首先，需要明确的是，论文查重系统（如知网、Turnitin、PaperYY等）主要针对的是已发表的学术论文、期刊文章、会议论文等文字内容进行比对，目的是检测是否存在抄袭或重复内容。而专利则是由国家知识产权局或国际专利组织发布的法律文件，主要用于保护发明人的技术成果。
尽管如此，部分查重系统会将专利文献作为参考文献纳入其数据库中。例如，知网的“科技查新”功能可以检索到部分专利信息，这可能导致在论文写作过程中引用专利内容时，被系统识别为相似内容。特别是当论文中直接引用了专利的技术方案、描述方式或结构时，可能会触发查重系统的警报。
此外，一些高校或科研机构在进行论文审核时，可能会要求作者提供专利检索报告，以确保论文内容不与已有专利发生冲突。这种情况下，虽然不是查重系统直接检测，但仍然涉及到专利与论文之间的关联性分析。
需要注意的是，专利的内容通常具有较高的创新性和独特性，因此即使被查重系统标记为相似内容，也不一定意味着存在抄袭行为。关键在于是否合理引用和说明来源。
总之，专利本身不会直接与论文进行查重，但在特定情况下，专利内容可能会影响论文的查重结果。因此，在撰写论文时，应合理引用专利，并注意保持原创性，避免不必要的重复风险。